Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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