Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga11P61622 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga11P61622 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga11P61622 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga11P61622 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga11P61622 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga11P61622 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga11P61622 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms