Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Depdc5P61460 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Depdc5P61460 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Depdc5P61460 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Depdc5P61460 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Depdc5P61460 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Depdc5P61460 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Depdc5P61460 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Depdc5P61460 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Depdc5P61460 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Depdc5P61460 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Depdc5P61460 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Depdc5P61460 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Depdc5P61460 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Depdc5P61460 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Depdc5P61460 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Depdc5P61460 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Depdc5P61460 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Depdc5P61460 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Depdc5P61460 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Depdc5P61460 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Depdc5P61460 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Depdc5P61460 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Depdc5P61460 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Depdc5P61460 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Depdc5P61460 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Depdc5P61460 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Depdc5P61460 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Depdc5P61460 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Depdc5P61460 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Depdc5P61460 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Depdc5P61460 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Depdc5P61460 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Depdc5P61460 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Depdc5P61460 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms