Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr2fP61219 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Polr2fP61219 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Polr2fP61219 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr2fP61219 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr2fP61219 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr2fP61219 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr2fP61219 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr2fP61219 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr2fP61219 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr2fP61219 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr2fP61219 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr2fP61219 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr2fP61219 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr2fP61219 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr2fP61219 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr2fP61219 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr2fP61219 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr2fP61219 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr2fP61219 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr2fP61219 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr2fP61219 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr2fP61219 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr2fP61219 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr2fP61219 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr2fP61219 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr2fP61219 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr2fP61219 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr2fP61219 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr2fP61219 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr2fP61219 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr2fP61219 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr2fP61219 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr2fP61219 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr2fP61219 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr2fP61219 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr2fP61219 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr2fP61219 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms