Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup43P59235 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup43P59235 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup43P59235 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup43P59235 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup43P59235 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup43P59235 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup43P59235 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup43P59235 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup43P59235 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms