Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gp1bbP56400 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 173.5 ms