Protein–RNA interactions for Protein: P55271

Cdkn2b, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor B, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2bP55271 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2bP55271 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms