Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GemP55041 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GemP55041 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GemP55041 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GemP55041 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GemP55041 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GemP55041 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GemP55041 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GemP55041 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GemP55041 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GemP55041 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GemP55041 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GemP55041 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GemP55041 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GemP55041 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GemP55041 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GemP55041 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GemP55041 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GemP55041 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GemP55041 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GemP55041 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GemP55041 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GemP55041 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GemP55041 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GemP55041 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GemP55041 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GemP55041 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GemP55041 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GemP55041 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GemP55041 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GemP55041 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GemP55041 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GemP55041 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GemP55041 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GemP55041 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GemP55041 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GemP55041 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GemP55041 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GemP55041 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GemP55041 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GemP55041 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GemP55041 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GemP55041 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GemP55041 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GemP55041 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GemP55041 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GemP55041 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GemP55041 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GemP55041 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GemP55041 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GemP55041 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GemP55041 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GemP55041 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GemP55041 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GemP55041 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GemP55041 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GemP55041 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GemP55041 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GemP55041 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GemP55041 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GemP55041 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GemP55041 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GemP55041 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GemP55041 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GemP55041 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GemP55041 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GemP55041 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GemP55041 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GemP55041 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GemP55041 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GemP55041 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GemP55041 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GemP55041 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GemP55041 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GemP55041 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GemP55041 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GemP55041 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GemP55041 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GemP55041 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GemP55041 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GemP55041 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GemP55041 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GemP55041 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GemP55041 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GemP55041 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GemP55041 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GemP55041 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GemP55041 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GemP55041 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GemP55041 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GemP55041 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GemP55041 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GemP55041 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GemP55041 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GemP55041 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GemP55041 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GemP55041 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GemP55041 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GemP55041 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GemP55041 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms