Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms