Protein–RNA interactions for Protein: P52431

Pold1, DNA polymerase delta catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold1P52431 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pold1P52431 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pold1P52431 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pold1P52431 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pold1P52431 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pold1P52431 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pold1P52431 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pold1P52431 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pold1P52431 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pold1P52431 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Pold1P52431 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms