Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms