Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr5P51682 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms