Protein–RNA interactions for Protein: P50715

Defa-rs7, Alpha-defensin-related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs7P50715 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs7P50715 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs7P50715 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs7P50715 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs7P50715 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs7P50715 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs7P50715 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs7P50715 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs7P50715 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs7P50715 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs7P50715 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs7P50715 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs7P50715 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs7P50715 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs7P50715 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs7P50715 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs7P50715 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs7P50715 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa-rs7P50715 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs7P50715 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs7P50715 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs7P50715 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs7P50715 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs7P50715 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs7P50715 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs7P50715 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs7P50715 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs7P50715 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs7P50715 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs7P50715 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs7P50715 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs7P50715 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs7P50715 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs7P50715 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs7P50715 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs7P50715 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs7P50715 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs7P50715 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs7P50715 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa-rs7P50715 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa-rs7P50715 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms