Protein–RNA interactions for Protein: P43241

Cdx2, Homeobox protein CDX-2, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx2P43241 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Cdx2P43241 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Cdx2P43241 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdx2P43241 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdx2P43241 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdx2P43241 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdx2P43241 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdx2P43241 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Cdx2P43241 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Cdx2P43241 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdx2P43241 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Cdx2P43241 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdx2P43241 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdx2P43241 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdx2P43241 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdx2P43241 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdx2P43241 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdx2P43241 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Cdx2P43241 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdx2P43241 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdx2P43241 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Cdx2P43241 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms