Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TfamP40630 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TfamP40630 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TfamP40630 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TfamP40630 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TfamP40630 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TfamP40630 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TfamP40630 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TfamP40630 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TfamP40630 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TfamP40630 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TfamP40630 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TfamP40630 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TfamP40630 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TfamP40630 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TfamP40630 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TfamP40630 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TfamP40630 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TfamP40630 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TfamP40630 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TfamP40630 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TfamP40630 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TfamP40630 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TfamP40630 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TfamP40630 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TfamP40630 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TfamP40630 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TfamP40630 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TfamP40630 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TfamP40630 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TfamP40630 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TfamP40630 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TfamP40630 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TfamP40630 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TfamP40630 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TfamP40630 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TfamP40630 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TfamP40630 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TfamP40630 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TfamP40630 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TfamP40630 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TfamP40630 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TfamP40630 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TfamP40630 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TfamP40630 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TfamP40630 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TfamP40630 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TfamP40630 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TfamP40630 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TfamP40630 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TfamP40630 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TfamP40630 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TfamP40630 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TfamP40630 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TfamP40630 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TfamP40630 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TfamP40630 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TfamP40630 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TfamP40630 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TfamP40630 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TfamP40630 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TfamP40630 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TfamP40630 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TfamP40630 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TfamP40630 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TfamP40630 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TfamP40630 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TfamP40630 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TfamP40630 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TfamP40630 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TfamP40630 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TfamP40630 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TfamP40630 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TfamP40630 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TfamP40630 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TfamP40630 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TfamP40630 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TfamP40630 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TfamP40630 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TfamP40630 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TfamP40630 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TfamP40630 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TfamP40630 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TfamP40630 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TfamP40630 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TfamP40630 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TfamP40630 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TfamP40630 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TfamP40630 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TfamP40630 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TfamP40630 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TfamP40630 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TfamP40630 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TfamP40630 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TfamP40630 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TfamP40630 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TfamP40630 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TfamP40630 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TfamP40630 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TfamP40630 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms