Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf2P39429 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf2P39429 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf2P39429 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf2P39429 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf2P39429 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf2P39429 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf2P39429 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf2P39429 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf2P39429 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms