Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TtlP38585 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TtlP38585 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TtlP38585 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TtlP38585 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TtlP38585 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TtlP38585 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TtlP38585 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TtlP38585 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TtlP38585 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TtlP38585 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TtlP38585 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TtlP38585 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TtlP38585 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TtlP38585 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TtlP38585 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TtlP38585 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TtlP38585 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TtlP38585 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TtlP38585 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TtlP38585 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TtlP38585 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TtlP38585 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TtlP38585 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TtlP38585 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TtlP38585 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TtlP38585 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TtlP38585 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TtlP38585 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TtlP38585 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TtlP38585 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TtlP38585 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TtlP38585 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TtlP38585 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TtlP38585 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TtlP38585 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TtlP38585 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TtlP38585 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TtlP38585 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TtlP38585 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TtlP38585 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TtlP38585 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TtlP38585 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TtlP38585 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TtlP38585 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TtlP38585 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TtlP38585 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TtlP38585 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TtlP38585 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TtlP38585 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TtlP38585 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TtlP38585 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TtlP38585 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TtlP38585 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TtlP38585 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TtlP38585 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TtlP38585 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TtlP38585 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TtlP38585 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TtlP38585 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TtlP38585 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TtlP38585 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TtlP38585 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TtlP38585 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TtlP38585 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TtlP38585 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TtlP38585 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TtlP38585 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TtlP38585 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TtlP38585 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TtlP38585 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TtlP38585 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TtlP38585 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TtlP38585 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TtlP38585 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TtlP38585 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TtlP38585 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TtlP38585 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TtlP38585 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TtlP38585 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TtlP38585 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TtlP38585 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TtlP38585 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TtlP38585 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TtlP38585 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TtlP38585 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TtlP38585 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TtlP38585 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TtlP38585 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TtlP38585 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TtlP38585 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TtlP38585 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TtlP38585 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TtlP38585 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TtlP38585 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TtlP38585 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TtlP38585 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TtlP38585 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TtlP38585 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TtlP38585 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms