Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms