Protein–RNA interactions for Protein: P35460

Ly6f, Lymphocyte antigen 6F, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6fP35460 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms