Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms