Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms