Protein–RNA interactions for Protein: P31361

Pou3f3, POU domain, class 3, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f3P31361 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pou3f3P31361 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pou3f3P31361 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pou3f3P31361 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou3f3P31361 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou3f3P31361 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou3f3P31361 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou3f3P31361 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou3f3P31361 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou3f3P31361 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou3f3P31361 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou3f3P31361 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou3f3P31361 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou3f3P31361 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou3f3P31361 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou3f3P31361 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou3f3P31361 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou3f3P31361 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou3f3P31361 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou3f3P31361 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou3f3P31361 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pou3f3P31361 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms