Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms