Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VtnP29788 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VtnP29788 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VtnP29788 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VtnP29788 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VtnP29788 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VtnP29788 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VtnP29788 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VtnP29788 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VtnP29788 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VtnP29788 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VtnP29788 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VtnP29788 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VtnP29788 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VtnP29788 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VtnP29788 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VtnP29788 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VtnP29788 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VtnP29788 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VtnP29788 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VtnP29788 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VtnP29788 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VtnP29788 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VtnP29788 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VtnP29788 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VtnP29788 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VtnP29788 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VtnP29788 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VtnP29788 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VtnP29788 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VtnP29788 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VtnP29788 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VtnP29788 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VtnP29788 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VtnP29788 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VtnP29788 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VtnP29788 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VtnP29788 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VtnP29788 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VtnP29788 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VtnP29788 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VtnP29788 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VtnP29788 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VtnP29788 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VtnP29788 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VtnP29788 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VtnP29788 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VtnP29788 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VtnP29788 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VtnP29788 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VtnP29788 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VtnP29788 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VtnP29788 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VtnP29788 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VtnP29788 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VtnP29788 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VtnP29788 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VtnP29788 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VtnP29788 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VtnP29788 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VtnP29788 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VtnP29788 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VtnP29788 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VtnP29788 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VtnP29788 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VtnP29788 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VtnP29788 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VtnP29788 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VtnP29788 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VtnP29788 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VtnP29788 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VtnP29788 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VtnP29788 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VtnP29788 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VtnP29788 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VtnP29788 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VtnP29788 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VtnP29788 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VtnP29788 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VtnP29788 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VtnP29788 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VtnP29788 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VtnP29788 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VtnP29788 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VtnP29788 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VtnP29788 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VtnP29788 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VtnP29788 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VtnP29788 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VtnP29788 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VtnP29788 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VtnP29788 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VtnP29788 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VtnP29788 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VtnP29788 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VtnP29788 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VtnP29788 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VtnP29788 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VtnP29788 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VtnP29788 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms