Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcdP28867 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms