Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apex1P28352 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apex1P28352 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Apex1P28352 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apex1P28352 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apex1P28352 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apex1P28352 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Apex1P28352 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apex1P28352 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms