Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CenpbP27790 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CenpbP27790 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CenpbP27790 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CenpbP27790 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CenpbP27790 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CenpbP27790 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CenpbP27790 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CenpbP27790 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CenpbP27790 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms