Protein–RNA interactions for Protein: P26049

Gabra3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra3P26049 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms