Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cdk11bP24788 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms