Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkchP23298 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkchP23298 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkchP23298 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkchP23298 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkchP23298 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms