Protein–RNA interactions for Protein: P21275

Bmp4, Bone morphogenetic protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp4P21275 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bmp4P21275 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms