Protein–RNA interactions for Protein: P21237

Bdnf, Brain-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BdnfP21237 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BdnfP21237 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BdnfP21237 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BdnfP21237 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BdnfP21237 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BdnfP21237 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BdnfP21237 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BdnfP21237 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms