Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a1P19437 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms