Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnnc1P19123 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms