Protein–RNA interactions for Protein: P16015

Ca3, Carbonic anhydrase 3, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca3P16015 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ca3P16015 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ca3P16015 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ca3P16015 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ca3P16015 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ca3P16015 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ca3P16015 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ca3P16015 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ca3P16015 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ca3P16015 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ca3P16015 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms