Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rag1P15919 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rag1P15919 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rag1P15919 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rag1P15919 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rag1P15919 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rag1P15919 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rag1P15919 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms