Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrphP15331 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrphP15331 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrphP15331 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrphP15331 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrphP15331 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrphP15331 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrphP15331 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrphP15331 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrphP15331 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrphP15331 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrphP15331 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrphP15331 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrphP15331 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrphP15331 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrphP15331 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrphP15331 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrphP15331 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrphP15331 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrphP15331 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrphP15331 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrphP15331 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrphP15331 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrphP15331 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrphP15331 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrphP15331 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrphP15331 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrphP15331 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrphP15331 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrphP15331 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrphP15331 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrphP15331 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrphP15331 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrphP15331 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrphP15331 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrphP15331 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrphP15331 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrphP15331 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrphP15331 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrphP15331 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrphP15331 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrphP15331 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrphP15331 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrphP15331 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrphP15331 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrphP15331 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrphP15331 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrphP15331 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrphP15331 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrphP15331 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrphP15331 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrphP15331 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrphP15331 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PrphP15331 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrphP15331 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrphP15331 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrphP15331 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrphP15331 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrphP15331 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrphP15331 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrphP15331 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrphP15331 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrphP15331 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrphP15331 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrphP15331 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PrphP15331 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrphP15331 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrphP15331 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrphP15331 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrphP15331 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PrphP15331 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrphP15331 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrphP15331 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrphP15331 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrphP15331 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrphP15331 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrphP15331 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrphP15331 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrphP15331 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrphP15331 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrphP15331 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PrphP15331 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrphP15331 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrphP15331 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrphP15331 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrphP15331 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrphP15331 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrphP15331 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrphP15331 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrphP15331 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrphP15331 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PrphP15331 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrphP15331 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrphP15331 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrphP15331 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrphP15331 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrphP15331 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrphP15331 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrphP15331 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrphP15331 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms