Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms