Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms