Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calb1P12658 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Calb1P12658 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calb1P12658 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Calb1P12658 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Calb1P12658 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Calb1P12658 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calb1P12658 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calb1P12658 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms