Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chrm1P12657 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chrm1P12657 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms