Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga5P11688 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga5P11688 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga5P11688 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga5P11688 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga5P11688 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga5P11688 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms