Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd4P10628 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd4P10628 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxd4P10628 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms