Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Schip1P0DPB4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms