Protein–RNA interactions for Protein: P0DN90

Tmem254b, Transmembrane protein 254b, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254bP0DN90 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem254bP0DN90 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms