Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spta1P08032 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spta1P08032 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spta1P08032 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Spta1P08032 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spta1P08032 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spta1P08032 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spta1P08032 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spta1P08032 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spta1P08032 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spta1P08032 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spta1P08032 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms