Protein–RNA interactions for Protein: P07141

Csf1, Macrophage colony-stimulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1P07141 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csf1P07141 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csf1P07141 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csf1P07141 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csf1P07141 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csf1P07141 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Csf1P07141 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms