Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TnfP06804 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TnfP06804 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TnfP06804 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TnfP06804 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TnfP06804 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TnfP06804 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TnfP06804 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TnfP06804 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TnfP06804 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TnfP06804 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TnfP06804 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TnfP06804 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TnfP06804 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TnfP06804 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TnfP06804 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TnfP06804 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TnfP06804 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TnfP06804 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TnfP06804 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TnfP06804 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TnfP06804 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TnfP06804 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TnfP06804 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TnfP06804 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TnfP06804 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TnfP06804 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TnfP06804 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TnfP06804 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TnfP06804 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TnfP06804 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TnfP06804 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TnfP06804 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TnfP06804 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TnfP06804 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TnfP06804 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TnfP06804 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TnfP06804 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TnfP06804 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TnfP06804 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TnfP06804 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TnfP06804 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TnfP06804 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
TnfP06804 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TnfP06804 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TnfP06804 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TnfP06804 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TnfP06804 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TnfP06804 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TnfP06804 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TnfP06804 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TnfP06804 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TnfP06804 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TnfP06804 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TnfP06804 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TnfP06804 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TnfP06804 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TnfP06804 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TnfP06804 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TnfP06804 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TnfP06804 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TnfP06804 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TnfP06804 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TnfP06804 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TnfP06804 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TnfP06804 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TnfP06804 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TnfP06804 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TnfP06804 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TnfP06804 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TnfP06804 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TnfP06804 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TnfP06804 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TnfP06804 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TnfP06804 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TnfP06804 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TnfP06804 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TnfP06804 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TnfP06804 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TnfP06804 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TnfP06804 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TnfP06804 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TnfP06804 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TnfP06804 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TnfP06804 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TnfP06804 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TnfP06804 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TnfP06804 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TnfP06804 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TnfP06804 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TnfP06804 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TnfP06804 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TnfP06804 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TnfP06804 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TnfP06804 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TnfP06804 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TnfP06804 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TnfP06804 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TnfP06804 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TnfP06804 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms