Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lamc1P02468 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lamc1P02468 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lamc1P02468 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lamc1P02468 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lamc1P02468 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lamc1P02468 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lamc1P02468 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lamc1P02468 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lamc1P02468 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lamc1P02468 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lamc1P02468 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lamc1P02468 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lamc1P02468 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lamc1P02468 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lamc1P02468 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Lamc1P02468 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lamc1P02468 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lamc1P02468 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lamc1P02468 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lamc1P02468 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Lamc1P02468 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lamc1P02468 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lamc1P02468 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lamc1P02468 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lamc1P02468 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lamc1P02468 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lamc1P02468 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lamc1P02468 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lamc1P02468 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lamc1P02468 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lamc1P02468 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lamc1P02468 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lamc1P02468 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lamc1P02468 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lamc1P02468 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lamc1P02468 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Lamc1P02468 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms