Protein–RNA interactions for Protein: P01680

Ig kappa chain V-IV region S107B, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01680 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01680 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01680 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01680 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01680 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01680 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01680 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01680 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01680 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01680 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01680 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
P01680 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01680 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01680 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01680 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01680 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01680 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01680 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01680 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01680 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01680 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01680 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01680 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01680 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01680 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01680 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01680 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01680 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01680 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01680 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01680 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01680 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01680 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
P01680 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01680 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01680 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01680 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01680 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01680 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01680 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01680 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01680 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01680 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01680 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01680 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01680 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01680 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01680 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01680 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01680 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01680 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01680 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01680 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01680 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01680 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P01680 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01680 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01680 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01680 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01680 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01680 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01680 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01680 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01680 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P01680 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01680 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01680 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01680 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01680 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01680 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01680 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
P01680 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01680 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
P01680 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01680 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01680 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01680 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01680 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01680 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01680 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01680 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01680 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01680 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01680 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01680 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01680 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01680 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01680 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01680 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01680 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01680 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01680 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01680 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01680 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01680 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01680 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01680 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01680 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01680 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01680 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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